Moin Thomas,
PDFCreator passt das Format der Hintergrund PDF gegebenenfalls auf das für die Ausgabe verwendete Format an. Der Inhalt der Hintergrund PDF sollte soweit ich weiß keinen Unterschied machen.
Ich konnte den Fehler unter PDFCreator Professional 4.0.3 nicht nachstellen. Verwendest du bereits die aktuellste Version?